不外乎下面这几点：一、保皇位 。 朱棣费尽千辛万苦抢来皇位很不容易，他的做法在人们心目中被视为篡位 。 名不正则言不顺，因此他若要保住皇位，就得拼命掩盖篡位的恶名，想尽千方百计来证明自己皇位的合法性 。 于是就得打出正牌来 。 如果出身既是庶出，又是篡位，这皇帝能不能当下去还真不好说 。 我们在这里揣测一下，朱棣每当想到不能承认亲生母亲的身份，不能给她应得的荣誉和地位，一定非常苦恼，非常愧疚 。 可这事又万万不能对外人讲，也就只好把母亲的牌位放到寺庙里，在心里默默请求母亲原谅自己 。 人在江湖身不由己，为了坐稳皇帝的宝座，他只能忍痛这样处理了！
二、争正统 。 马皇后是正牌皇后，因此说是她生的，身份自然就是正统的了 。 同时也就可以为朱棣的夺权找到借口——当初朱元璋和马皇后原本就是想把皇位传给朱棣的，只是因为有人出坏主意，才传给了皇太孙朱允炆 。 另一方面，朱棣说自己是马皇后生的，也就比太子妃生的朱允炆的地位更正统了 。
三、怕舆论、要面子 。 朱棣的生母碽氏是一位蒙古族的女性 。 在今天看来，这当然算是一件好事，因为少数民族在工作学习生活中会有一些优待政策 。 可在当时，就完全不是这么回事了 。 朱元璋是从蒙古族统治者手中夺得天下的，当时元朝残余势力虽然退到大漠以北，可仍然苟延残喘地与明朝对峙，双方还在打仗 。 朱棣若承认是碽氏所生，就等于承认自己是蒙古族的后代 。 这就是朱棣不能公开认自己蒙古族生母的主要原因 。
朱棣不公开认生母一事虽然有许多历史原因，但不管怎么说，还是主要因为在他的眼里，皇帝宝座重于亲情 。 从小浸染权欲的朱棣，终究无法摆脱权力这枚糖衣炮弹的利诱 。
朱棣的亲生母亲碽氏最终连一座坟墓都没有留下，而这段历史，也最终被朱棣带入了他的坟墓之中，从此没有人能够知道当时的真相 。 这成为后世的史学家们花费心思去考证的历史疑点，终归让人感到有些遗憾和可悲 。 （
朱棣的生母到底是谁? 总起来看，关于成祖生母问题的说法主要有三种：
马皇后说 。 明成祖朱棣自称是孝慈高皇后（即马皇后）所生 。 马皇后，凤阳宿县（今安徽宿县）人，濠州红巾军郭子兴养女 。 至正十二年（1352）郭子兴将其许配给部将朱元璋 。 当年朱元璋受到了郭子兴的猜忌，马氏多次从中调解周旋 。 明朝建立后，朱元璋册封她为皇后，对她十分信赖，多次听从她的意见宽免大臣过错，因此有人将她与历史上的贤后唐代长孙皇后相提并论 。
《太祖实录》和《太宗实录》都说朱棣为马皇后所生，后来的史籍如《明史》等正史多因循这种说法 。
但是除朱棣外，马皇后亲生皇子都有谁，又有着不同的解释 。 一种说法认为马皇后生懿文太子、秦王、晋王、燕王、周王 。 朱棣在夺取皇位后，马上让人编了一部叫《奉天靖难记》的书，为自己篡夺皇位辩解 。 该书开卷就标榜自己是马皇后的嫡子：“今上皇帝（指成祖朱棣），太祖高皇帝第四子 。 母孝慈高皇后生五子：长懿文太子，次秦王，次晋王，次今上皇帝，次周王也 。 ”还有一种说法认为马皇后只亲生燕王，周王，懿文太子、秦王、晋王都不是马皇后亲生 。 其实仔细推敲起来就会发现，《太祖实录》为成祖朱棣所修（成祖为了抹杀自己即位前的真实事实，曾两次改修《太祖实录》，删减篡改之处甚多），《太宗实录》为宣宗所修北京觉生寺永乐大钟，其中自然也有粉饰的成分，当然宣称朱棣为马皇后的嫡子 。
另外还有人认为马皇后根本就没有皇子，这几个都不是她亲生的，只不过是抱过来抚养成人而已 。
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